出版研究所主要承担出版业的宏观产业政策、法律法规、出版物市场状况以及出版企业组织等出版应用学科方面的研究工作。既为新闻出版总局提供理论上的决策支持，也为微观出版组织提供权威的行业信息。内设基础理论研究室、应用理论研究室、国际出版研究室。

 传媒研究所主要承担制订传媒领域研究计划，并组织实施；提供传媒领域决策支持与咨询服务；从事传媒产业、传媒公共文化服务体系、传媒传播力与竞争力、传媒企业组织、传媒管理等课题研究。

 印刷研究所于2012年由国家新闻出版总署批准成立，主要业务包括：负责制订印刷复制领域研究计划并组织实施，承担印刷复制领域的科研项目和课题研究，组织编写和发布相关报告与著述，开展相关领域信息交流与人才培训等。

 市场（发行）研究所的主要业务包括：出版产业研究、出版企业管理研究、出版物市场研究等。

 数字出版研究所主要承担出版行业的数字化和新兴数字媒体等研究领域，包括音像出版研究、电子出版研究、网络出版研究以及新技术在出版中的应用研究等。

 标准化研究所是国内唯一的国家级新闻出版领域标准化研究机构，研究范围包括：新闻出版业标准化宏观战略政策、体系规划、基础理论、高新技术、国际标准、符合性测试等多个领域。